應北京大學的邀請，2009年7月6日至7日，西安交大附中王佩東校長對北大進行了為期兩天的友好訪問。同時，應邀訪問的還有人大附中校長、北京四中校長、上海中學校長等80余所國內(nèi)一流中學的校長。

7月6日下午，在北大博雅國際會議中心，王佩東校長參加了“北京大學自主招生研討會”。會上，王佩東校長介紹了西安交大附中近年來的發(fā)展及給北大輸送人才的情況。就北大自主招生的話題，王佩東校長認為，自主招生是一個很好的選拔優(yōu)秀人才的方法和途徑，希望北大能以更加開放的姿態(tài)和靈活的方式選拔優(yōu)秀人才。

7月7日上午，王佩東校長應邀參加了北京大學2009年本科生畢業(yè)典禮暨學位授予儀式，北京大學黨委書記閔維方、校長周其鳳等領導及許多著名學者等出席了畢業(yè)典禮。2009年北京大學共有3000多名本科學生順利完成學業(yè)，獲授學士學位。莘莘學子心，濃濃恩師情。在典禮上，王佩東校長與在北大今年剛完成本科學業(yè)的西安交大附中學子師安、史鈔、路桐等同學歡聚一堂，師安等同學身著學士服，代表北大即將畢業(yè)的西安交大附中學子，向王佩東校長獻上了一大束美麗的鮮花，表達對母校質(zhì)樸的、深厚的感激之情。

典禮結(jié)束后，在北大博雅國際會議中心，王佩東校長與北京大學及清華大學今年剛完成本科學業(yè)的部分西安交大附中學子歡聚一堂，認真聽取了每一位同學大學四年的學業(yè)情況及學業(yè)感悟，還關心地詢問了同學們的畢業(yè)去向，并代表母校祝福他們鵬程萬里，并指出在前進的路上母校永遠都是他們堅實的后盾。會談在溫暖、感恩的氛圍中進行，最后，王佩東校長與同學們一起合影留念。

此次訪問交流活動，陜西省有兩所示范高中受邀參加。在為期兩天的考察訪問中，王佩東校長還與北京大學校長周其鳳院士等多位校領導就素質(zhì)教育和人才培養(yǎng)等教育議題進行了交流和探討。